Просмотр вопроса

Если будет один договор продажи на 2 млн. - будут платить налоги с 1 млн рублей. А если продажа пройдет по двум отдельным договорам по 1 млн рублей, то налог начислен не будет.

Здравствуйте. В  соответствии с п.1 п.1 ст. 220 НК РФ при определении размера налоговой базы налогоплательщик имеет право на получение имущественного налогового вычета в суммах, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи, в частности, жилых домов, квартир, комнат и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика менее трех лет, но не превышающих в целом 1000000 руб.
Поэтому Вам при продаже квартиры лучше воспользоваться отдельным договором купли-продажи долей для каждого собственника, тогда согласно данной выше статье налога не возникнет. При условии, что Вы оба являетесь налоговыми резидентами РФ.